<div dir="ltr"><div>After discussion at NIAC, I have revised the NXmx 1.5 proposal in the NXmx_multimodule_and_dectris_<wbr>changes branch and on the <a href="http://hdrmx.medsbio.org">hdrmx.medsbio.org</a> web site.  The main change was to add an enumeration of the beam profile choices to include a rectangular option.<br><br></div>We also have some changes to the NXtransformations 1.1 proposal.  That is still to be drafted in detail.<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Oct 5, 2016 at 9:42 PM, Herbert J. Bernstein <span dir="ltr"><<a href="mailto:yayahjb@gmail.com" target="_blank">yayahjb@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="m_5533533629043109159gmail-comment-body m_5533533629043109159gmail-markdown-body m_5533533629043109159gmail-markdown-format m_5533533629043109159gmail-js-comment-body">
        <p>In preparation for the NIAC meeting:<br></p><p>I have created a branch, 
NXmx_multimodule_and_dectris_<wbr>changes, with a draft of the proposed 
changes to NXmx and NXtransformations.  You can see the nxdl files in 
that branch on github.  You can see the definitions at:</p>

<p><a href="http://hdrmx.medsbio.org/NIAC_2016/manual/build/html/classes/applications/NXmx.html?highlight=nxmx" target="_blank">http://hdrmx.medsbio.org/NIAC_<wbr>2016/manual/build/html/<wbr>classes/applications/NXmx.<wbr>html?highlight=nxmx</a></p>

<p>and</p>

<p><a href="http://hdrmx.medsbio.org/NIAC_2016/manual/build/html/classes/base_classes/NXtransformations.html?highlight=nxtransformations" target="_blank">http://hdrmx.medsbio.org/NIAC_<wbr>2016/manual/build/html/<wbr>classes/base_classes/<wbr>NXtransformations.html?<wbr>highlight=nxtransformations</a></p>

<p>and the blank-suppressed differences at</p>

<p><a href="http://hdrmx.medsbio.org/NIAC_2016/NXmx.diff" target="_blank">http://hdrmx.medsbio.org/NIAC_<wbr>2016/NXmx.diff</a></p>

<p>and</p>

<p><a href="http://hdrmx.medsbio.org/NIAC_2016/NXtransformations.diff" target="_blank">http://hdrmx.medsbio.org/NIAC_<wbr>2016/NXtransformations.diff</a></p>

<p>The rationale for the proposed changes is as follows:</p>

<ol><li> NXmx changes
<br>1.1.  Version number updated from 1.4 to 1.5 -- to help software 
packages in distinguishing files made to conform to the changed version.
<br>1.2.  Add documentation of the possibility of a third image dimension.  
This case arises for the CSPAD and helps to organize data arrays to 
correspond to the module structure of multi-module detectors.  The main 
change was to add a variable dataRank to carry a rank of either 2 or 3 
and to add an optional index k after i and j.
<br>1.3.  Add explicit, but optional use of the NXdetector_group base class 
for the case of a detector in which each module has its own data array, 
rather than the case being considered in 1.2, above.  In this case the 
relationship among multiple the relationships among multiple NXdetector 
groups needs to be stated.  This was, of course, already an implicit 
option under NXmx 1.4, but now we are making the possibility explicit, 
with documentation that comes closer to the descriptions used with CBF 
for the same situation.  Note that CBF calls a NXdetector_group a 
detector and an NXdetector a detector element, and deal an 
NXdetector_module using and array_structure_list_section.
<br>1.4.  Add additional documentation in the NXmx use of NXdetector_module 
and add an optional data_stride field in the NXmx use of 
NXdetector_module for completeness.
<br>1.5.  Add optional new total_flux, incident_beam_size, and profile in 
the NXmx use of NXbeam.  These are needed to provide a place to put 
information crystallographers record</li><li> NXtransformations changes <br>2.1.  Version number updated from 1.0 to 1.1 -- to help software 
packages in distinguishing files made to conform to the changed version.
<br>2.2.  To help people understand the distinctions among axis types and 
what information they need to provide, add an explicit general axis 
type, for such things as the direction of gravity or other special 
reference coordinate axes they need to track but probably don't move, 
change from the upercase pseudovariable TRANSFORMATION to AXISNAME 
(making it consistent with NXDATA)  and make an new upper case 
pseudovariable AXISUNITS to help explain the units they need to provide 
for rotation and translation axes.
<br>2.3.  Add new AXISNAME_end, AXISNAME_range and AXISNAME_average_range 
fields to hold information on the scan steps taken in crystallographic 
experiments.    These are also needed to provide a place to put 
information crystallographers record.</li></ol>
    </div></div>
</blockquote></div><br></div>